بالإضافة إلى تميز البرامج الأكاديمية التي تقدمها الجامعة في مرحلتي البكالوريوس والدراسات العليا، وكون هذه البرامج معادلة من المجلس الأعلى للجامعات، فإن الميزة الرئيسة للجامعة المصرية للتعلم الالكتروني الاهلية هى المرونة وحرية الدراسة فى أى وقت وفى أى مكان بما يتناسب وظروف عملك وحياتك الشخصية ، هذا النظام المرن غير متوفر فى أى مكان آخر بالنسبة لتخصص التعلم الالكترونى.

توفر الجامعة نموذجاً تعليمياً مرناً صمم خصيصاً ليناسب من لا يتوافر لديهم الوقت الكافي لأسلوب التعليم التقليدي. الالتحاق بالجامعة سيمكنك من الدراسة بشكل سهل ومرن دون الإخلال بواجباتك الحياتية اليومية حيث تتوافر لديك المرونة –إلى حدٍ كبير - لتحديد وقت الدراسة المناسب دون التقيد بمواعيد ثابتة لحضور المحاضرات، ويتم ذلك عن خلال بيئة التعلم الإلكترونية والتي تحتوى على كل متطلبات الدراسة فى مكان واحد.

نظام الدراسة بالجامعة مثله مثل باقى أنظمة التعلم ولكن الفرق هو طريقة توصيل المادة العلمية بمعنى أن هناك بالطبع مناهج يلزم دراستها، ويساعدك فى ذلك أستاذ المادة، ولكن العبء الأكبر يقع عليك فى المذاكرة والتحصيل حيث أن طريقة الدراسة فى الجامعة تعتمد بشكل كبير على التعلم الذاتى.

النموذج الدراسي المستخدم في الجامعة هو نظام التعلم عن بعد باستخدام تقنيات التعلم الإلكتروني، تتم لقاءات عن طريق مؤتمرات الفيديو يشرح فيها أستاذ المادة الموضوعات الخاصة بالمقرر ، ويتوازى مع ذلك توافر كل العناصر المساعدة والمساندة للتعلم من محاضرات مصورة ومواد للقراءة والتعلم ومناقشات عن طريق منتديات المناقشة البنائية كل ذلك داخل بيئة التعلم الإلكتروني للجامعة دون الحاجة للحضور للجامعة بشكل منتظم أو يومي.